阳离子聚丙烯酰胺在制药厂废水处理可以使用，其效果一般是沉淀水中的杂质，因为制药厂废水有抗生素等成分，随意排放对水质影响非常大，需要进行各工艺分阶段处理。  
      制药厂废水的来源来自制药厂，包括工艺废水,机修、冲洗废水，初期雨水，职工生活污水等。
      制药废水分为生物制药废水和化学制药废水。生物制药废水的特点是高浓度的有机物，COD,BOD值波动较大，废水的BOD/COD值差异大，NH3-N浓度高，色度深，浓度大，ss高。化学制药废水的特点是COD高，含盐量高PH值变化大，肺水中成分单一不利于微生物成长，含有有毒及不易降解的物质。