针对新疆地区的壤土板结和盐碱化问题，可以考虑使用微生物菌剂进行防治。下面是具体的操作步骤：

1、选择适合当地生态环境的微生物菌剂，例如具有促进植物生长和抗逆能力的根际微生物菌剂，如枯草芽孢杆菌等。

2、在适宜的时间和条件下，喷洒微生物菌剂，如在播种前后、灌溉后等时机。可以使用水溶液、涂抹剂或直接混合在土壤中使用。

3、配合土壤调理措施，如适量的有机肥料、石灰等，调整土壤pH值，改善土壤结构。

4、加强排水设施建设，以减轻土壤中的盐分和水分积累，改善土壤环境。

5、种植耐盐碱的品种，避免棉花幼苗在根系发黑僵死的情况发生。

需要注意的是，在使用微生物菌剂防治盐碱化问题时，要结合具体的实际情况和具体的操作方案。同时，为了确保微生物菌剂的效果，应该选用质量可靠的产品，并按照说明书中的使用方法进行使用。