四极杆-静电场轨道阱-线性离子阱三合一组合式质谱。包含三个质量分析器，四极杆、Orbitrap和线性离子阱（LIT），具有超高分辨、高灵敏度、多级质谱能力，并且配备多种裂解模式（CID、HCD及可升级的ETD），非常适合蛋白质组学中复杂体系的高通量蛋白检测。

基本结构包括离子源、离子光学器件、质量分析仪和检测器。

离子源

连接到LC的离子源是大气压电离（API）。API源用作LC和MS之间的接口，包括以下电离技术：加热电喷雾电离（H-ESI），大气压化学电离（APCI）和大气压光电离（APPI）。除了API离子源外，在电动离子漏斗后面的API离子源界面中还有**个离子源（RIS）。

离子光学器件

离子光学器件将气相样品离子聚焦并加速进入质量分析仪。它包括MP00离子光学器件、MP0离子光学器件、MP1离子光学器件、弯曲线性阱（C型阱）、离子路由多极（IRM）、MP3离子光学器件和DC偏移电压。MP00离子光学器件包括MP00 RF透镜和L0透镜，位于API源接口和MP0离子光学器件之间。MP0离子光学系统，也称为有源束波导（ABG），将来自MP00离子光学系统的离子沿中心轴通过90度弧线传输到四极。90度电弧可通过防止中性物质和高速团簇进入四极杆来降低噪音。MP1离子光学器件充当离子传输设备，通过MS向棒施加射频（RF）电压以产生电场，沿着四极杆的轴引导离子，从而将离子从四极杆传输到C阱。进入C阱后，离子通过与氮气碰撞气体碰撞而失去其动能，并聚集在C阱的中心轴上。IRM包含一个安装在金属管内的多极直管，直接对准C阱。将电势梯度施加到多极管以快速提取离子。MP3离子光学器件可以通过将射频电压施加到杆上的方式把离子从IRM传输到双压LIT，以产生沿多极轴引导离子的电场。

质量分析仪

Thermo Orbitrap Fusion三合一高分辨质谱仪包含三个质量分析仪，四极杆、Orbitrap和LIT。

四极质量分析仪（Q1）包含四个圆杆。MS向杆施加RF电压和DC偏移电压。当将可变幅度的RF和DC电压施加到可以产生电场的四极杆时，电场可以使具有特定m/z的离子产生稳定的振荡，而对所有其他离子产生不稳定的振荡。即，Q1用作质量过滤器，使选定的离子能够通过杆。四极杆仅在施加RF电压时用作离子传输设备

轴对称的Orbitrap质量分析仪包含一个纺锤状的中心电极，该中心电极被一对钟形的外部电极围绕。运动的离子可能被静电场捕获。离子在Orbitrap内部经过静电场，迫使它们以复杂的螺旋形运动。这些振荡的轴向分量可以通过电极的两半检测为镜像电流。使用傅里叶变换将图像电流转换为质谱图。

LIT质量分析器是双单元二维LIT质量分析器，由前转移透镜（TL1）、高压LIT池、中心转移透镜（TL2）、低压LIT池和后转移镜头（TL3）组成。质量分析器单元内部是精密加工和**对齐的双曲线杆的方形阵列，该杆具有前、中、后三个部分。

LIT质量分析仪进行的步骤包括离子存储、离子隔离、碰撞诱导解离（CID）和离子扫描。对于SIM或MSn，LIT质量分析仪将离子隔离波形电压施加到X杆上，同时主AC电压斜率上升到新的存储电压，喷射出除选定m/z离子以外的所有离子。另外，对于MSn，LIT质量分析器将共振激发AC电压施加到X杆上，以产生CID。为了扫描出离子，主RF电压从低压上升到高压，同时MS向X杆施加共振喷射AC电压以促进喷射。随着主RF电压的增加，m/z值增加的离子变得不稳定，并通过X杆中的槽喷出。

离子检测系统

Orbitrap Fusion Lumos Tribrid三合一质谱仪具有高灵敏度和离轴离子检测系统。该检测系统包含两个转换打拿极和一个电子倍增器。它可产生高信噪比（S/N），与检测到的离子数量成正比，并且可以在正负离子工作模式之间切换电压极性。