无菌室的设计要按国家标准-2001《洁净厂房设计规范》、国家药品监督管理局颁发的《药品检验所实验室质量管理规范（试行）》中第十八条规定执行。

微生物实验室无菌室的施工、安装、验收应按国家行业标准JGJ71-1990《无菌室的施工及验收规范》执行。对于微生物检测工作者和使用管理者来讲，更大量的工作是进行正常管理到日常的使用。无菌室的标准要符合GMP洁净度标准要求。