人类在建港、填海、挖沙、疏浚、倾废、围垦、运动（游泳、帆船、滑水等）、旅游、航运、管线铺设等活动，而且对主要海洋生态可能有较大影响时，应进行海洋生态调查，调查要素主要包括位置、数量、规模、建设和营运情况，对海洋生物的影响程度等方面。

海洋生态调查分析通常包含以下内容：

1.生物量评价
评价对象：包括微生物、浮游植物群落、浮游动物群落、游泳动物群落、底栖生物群落、潮间带生物群落和污损生物群落等。

2.优势种评价
评价对象：包括浮游植物群落、浮游动物群落、游泳动物群落、底栖生物群落、潮间带生物群落和污损生物群落等。

3.指示种评价
评价对象包括浮游植物群落、浮游动物群落、游泳动物群落、底栖生物群落、潮间带生物群落和污损生物群落等。

4.关键种评价
评价对象为海洋食物网，包括浮游食物网、高营养阶层食物网、底栖碎屑食物网等。

5.物种多样性评价
评价对象：包括浮游植物群落、浮游动物群落、游泳动物群落、底栖生物群落、潮间带生物群落等。

 海洋生态调查主要项目和内容有：鱼类回避反应试验 、叶绿素-α 、细菌总数 、生物毒性试验浮游生物 、浮游动物、 粪大肠菌群 、大型底栖生物、赤潮毒素、 潮间带生物等。   

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